La Universidad de los Llanos es supervisada entre otras por las siguientes entidades:

La Contraloría General de la República (CGR)

Encargada de realizar control fiscal sobre la misma

La Procuraduría General de la Nación

Encargada de realizar control disciplinario de sus funcionarios.

Ministerio de Educación Nacional

Encargado de realizar control de calidad a los programas ofrecidos.